集菌儀是一次性使用全封閉集菌培養器或可反復使用集菌培養器的配套使用設施，供試品通過集菌儀的定向蠕動加壓作用，實施正壓過濾并在濾器內進行培養，以檢驗供試品是否含菌。供試品通過進樣管道連續被注入集菌培養器中，利用集菌培養器內形成的下壓，通過0.22µm、0.45µm、0.8µm孔徑的濾膜過濾，供試品中可能存在的微生物被截留收集在濾膜上，通過沖洗濾膜除去供試品的抑菌成分。然后把所需培養基通過進樣管道直接注入集菌培養器中，放置規定的溫度培養，觀察是否有長菌現象，符合藥碘規定，操作使用方便簡單。