1、實驗前，應先將濾杯清洗潔凈、曬干、取濾膜(50mm)侵泡到純化水里3~5min，濾杯及濾膜支撐網消毒備用（可采用火焰滅菌器快速消毒）。
2、用鑷子夾住濾膜放在抽濾設備的濾網上。
3、將其供試品注入過濾杯內，然后啟動真空泵，再翻開相應閥門，施行過濾集菌。
4、 供試品過濾集菌完畢后(濾膜上沒有水珠)，關閉真空泵開關，用無菌鑷子取出密封圈，在用無菌鑷子取出濾膜。
5、將濾膜貼到事前預備好的培育基上，菌面朝上，平貼，不得有氣泡。相應的液體培育基注入濾杯內，培育基掩蓋濾膜表面即可。
6、蓋上蓋子放置在生化培育箱及恒溫培育箱中，按規定溫度和時刻進行培育，逐日觀察、計數。
7、儀器正常性檢測:取600ml~1200ml純化水，每個濾杯注入100ml純化水,接通真空泵電源，再別離翻開相對應的閥門，施行抽濾(抽濾時刻1~5min為正常規模)，依據速度將預備好的純化水參加濾杯中，純水順利地從排液口流出，即視為微生物限度檢查儀儀器可正常作業,假如過濾速度過慢或無法過濾，請查看: A.管路銜接是否漏氣，濾杯密封性是否杰出； B.檢品是否含有較多不溶性的顆粒，懸浮物等； C.查看不銹鋼網片是否阻塞，不銹鋼底座出液孔是否阻塞。若屬其他原因，請與廠家聯絡。
8、清洗:微生物限度檢查儀長時間沒有運用,再次運用前儀器管路應對管路進行消毒，可采用以下消毒劑：
A乙醇 B新潔爾滅 C甲醛 D次氯酸溶液．消毒辦法：預備100ml消毒劑、200ml無菌水(不需微孔濾膜)； 先將100ml消毒劑過濾，堅持3~5分鐘，再將200ml無菌水進行過濾，即可完結管路消毒。
微生物限度檢測儀注意事項：
1.依據供試品性狀來挑選濾膜材質，過濾前后應確保濾膜的完整性；
2.儀器不作業時，請斷電；
3.不能抽濾強酸、強堿、強氧化劑、強腐蝕等液體；
4.當供試品中含有不溶性的顆粒，懸浮物時，可能導致濾膜阻塞影響過濾，應將供試品進行預處理，除掉顆粒或懸浮物；
5.抽濾前，應確保管道密封性杰出.